Shushanik Muradkhanyan wurde in Jerewan (Armenien) geboren und wuchs in einer Musikerfamilie auf. Ihren ersten Violinunterricht erhielt sie im Alter von sieben Jahren an der Spezialmusikschule P. I. Tschaikowski in Jerewan. 2013 nahm sie an der Cremona International Music Academy and Festival teil, wo sie den zweiten Preis sowie einen Sonderpreis für die Interpretation einer Beethoven-Sonate erhielt. Nach dem erfolgreichen Abschluss der Spezialmusikschule setzte sie ihre Ausbildung am Staatlichen Jerewan Komitas Konservatorium bei Prof. Artashes Mkrtchyan fort und schloss ihr Studium mit Auszeichnung ab. Im Studienjahr 2016/17 wurde sie vom All Armenian Fund als beste Studentin mit einem Stipendium geehrt. Seit 2009 tritt Shushanik Muradkhanyan regelmäßig als Solistin, Kammermusikerin und Orchestermusikerin auf. Von 2019 bis 2023 studierte sie an der Musikhochschule Lübeck in der Klasse von Prof. Elisabeth Weber. Ihr Studium ergänzte sie durch Meisterkurse bei Gerhard Schulz, David Geringas, Maxim Vengerov, Sergey Ostrovsky, Paul Cortese, Lorenzo Lucca und Mark Lakirovich. Während ihrer Studienzeit wirkte sie in verschiedenen Jugendorchestern mit, unter anderem im Baltic Sea-Projekt unter der Leitung von Kristjan Järvi sowie bei der Sommermusikakademie in Hundisburg unter der Leitung von Johannes Klumpp. 2020 erhielt sie eine Akademiestelle bei der Norddeutschen Philharmonie Rostock. 2021 folgte ein Zeitvertrag bei den Bremer Philharmonikern, und von 2022 bis 2023 war sie Akademistin beim Philharmonischen Staatsorchester Hamburg.

Seit 2023 ist Shushanik Muradkhanyan festes Mitglied der Norddeutschen Philharmonie Rostock in der Gruppe der ersten Violinen.